Une nouvelle espèce de champignon proche de l’Inocybe curvipes découverte au Québec : Inocybe squalida sp. nov. (Inocybaceae, Agaricales), Le Naturaliste canadien 2022, 146(1), 10-16.

Par Claude Kaufholtz-Couture et Pierre-Arthur Moreau

Résumé : Le genre Inocybe regroupe plusieurs espèces de champignons réparties sur l’ensemble du globe, en particulier dans les régions tempérées et boréales, et leur identification est  notoirement  difficile. Inocybe squalida C. Kaufholtz-Couture sp. nov. a été découvert au Québec lors d’inventaires de la biodiversité. Ses caractéristiques morphologiques en font un représentant typique du genre Inocybe : macroscopiquement, on note un pileus dissocié en petites squames et méchules, des lames aux contours lamellaires arrondis, sinuées à émarginées, jaunâtres devenant brun-olive par les spores, une absence de noircissement du stipe, une odeur spermatique typique du genre ; au microscope, on observe des cystides hyméniales caractéristiques (à paroi épaisse et avec des cristaux d’oxalate de calcium au sommet) et des basidiospores brunes, gibbeuses à silhouette triangulaire, comparables à celles d’une espèce commune, Inocybe curvipes, et d’espèces voisines moins connues. Après une revue de la littérature canadienne et mondiale, les auteurs ont pu confirmer Inocybe squalida comme nouvelle espèce pour la science grâce à des analyses moléculaires. Ils présentent une description détaillée de l’espèce accompagnée de photographies et le résultat de l’analyse moléculaire du marqueur ITS sous forme d’arbre phylogénétique. Ils discutent ensuite des affinités morphologiques et phylogénétiques de l’espèce.

Article en accès propriétaire : https://doi.org/10.7202/1086644ar

Tricholoma alpinum, sp. nov., under five-needle pines in alpine and subalpine zones in Japan, Mycologia, 2022, 114(1), 190-2022.

Par Wataru Aoki, Raymond Archambault, Jean Bérubé, Yves Lamoureux, Masaki Fukuda et Akiyoshi Yamada

Résumé : Alpine regions in Japan are characterized by the Siberian dwarf pine, Pinus pumila. Although these regions are conserved as national parks due to their unique biome, few reports of the fungal biota are available. We examined mushroom fungi under such vegetation and found a unique yellowish-capped Tricholoma species. Multilocus molecular phylogenetic analyses and morphological observation of specimens showed that the Tricholoma species is very similar to T. fumosoluteum known in North America. The Japanese yellowish-capped T. aff. fumosoluteum had larger basidiospores and basidia and shorter pileipellis hyphae compared with T. fumosoluteum. Therefore, we describe the Japanese entity as a new species, T. alpinum.

Article en accès propriétaire : https://doi.org/10.1080/00275514.2021.2018889

Macrofungal conservation in Canada and target species for assessment: a starting point, Facets 2022, 7(1).

Par Anna Bazzicalupo, Susana C. Gonçalves, Rémi Hébert, Sigrid Jakob, Alfredo Justo, Gavin Kernaghan, Renée Lebeuf, Bruce Malloch, R. Greg Thorn et Allison K. Walker

Quelques-unes des espèces ciblées par les chercheurs, en l'occurrence Gyromitra sphaerospora (photo de gauche de J. Landry, de Mycoquébec), Hapalopilus croceus (photo du centre de Y. Lamoureux) et Sarcosphaera coronaria (photo de droite de Renée Lebeuf).

Résumé : Despite the ecological importance of fungi, we still know little about their diversity in Canada. One of the largest hurdles to implementing fungal conservation initiatives is the lack of fungal distribution data. As anthropogenic impacts accelerate the speed of environmental change, it is imperative that we fill this major information gap, critical for fungal protection. To gain insight on the conservation status of Canadian macrofungi, we took advantage of the large and growing body of fungal biodiversity data from government research (Wild Species 2020), citizen science, trained independent mycologists, university, and museum biodiversity research. The majority of macrofungi are data deficient; we do not know their geographic distribution or habitat requirements, occurrence, or abundance in Canada. For mushrooms that fruit only a few days of the year and are often difficult to positively identify, there is a lot of work to overcome the uncertainty of distinguishing under-sampling from rarity. Our work stresses the importance of building a strong network of professional and amateur mycologists to develop resources, disseminate information to make educated decisions, and advance conservation actions. We found that several fungi can be prioritized; we present a short list for consideration for formal conservation assessment.

Article en accès libre : https://www.facetsjournal.com/doi/full/10.1139/facets-2021-0180

Hygrophorus sect. Olivaceoumbrini: new boundaries, extended biogeography and unexpected diversity unravelled by transatlantic studies, Persoonia 2021, 46, 272–312.

Par J.-M. Bellanger, R. Lebeuf, E. Sesli, M. Loizides, C. Schwarz, P.-A. Moreau, K. Liimatainen, E. Larsson

Résumé : As currently delineated, Hygrophorus sect. Olivaceoumbrini is a polyphyletic assembly within subg.  Colorati, encompassing glutinous and pigmented taxa. According to available literature, between a dozen and twenty species may belong in the section, mostly represented in continental and boreal forests of Europe and North America. However, the limited phylogenetic and biogeographic coverage of the genus does not presently allow for a reliable assessment of its taxonomic boundaries, nor does it provide a complete picture of species diversity within sect. Olivaceoumbrini. In an ongoing effort to confer an evolutionary backbone to Hygrophorus systematics, we assembled and analysed a dataset comprising 268 intercontinental sequences, including holotypes of 7 taxa previously not positioned phylogenetically, and enriched with collections from largely unexplored Mediterranean and Anatolian ecosystems. Overall, 30 clades are identified within 5 distinct lineages, including 11 species putatively new to science. Seven of these are formally described here as H. agathosmoides, H. albofloccosus, H. canadensis, H. limosus, H. marcocontui, H. pinophilus and H. pustulatoides spp. nov. This enriched coverage of section Olivaceoumbrini s.lat. calls for a re-evaluation of its natural boundaries into a core monophyletic clade, including H. olivaceoalbus and five closely related lookalikes, as well as the assignment of the section rank to the four remaining lineages: sect. Fuscocinerei sect. nov., sect. Limacini sect. nov., sect. Nudolidi sect. nov. and sect. Tephroleuci, respectively. We also stabilize the usage of six historical names, H. glutinifer, H. hyacinthinus, H. mesotephrus, H. olivaceoalbus, H. pustulatus and H. tephroleucus, through designation of two neotypes, three lectotypes and four epitypes.

Article en accès libre : https://doi.org/10.3767/persoonia.2021.46.10

Voir également, en français, l'article rédigé par Renée Lebeuf dans le blogue de Mycoquébe, intitulé Du nouveau chez les Hygrophorus. 

https://blog.mycoquebec.org/blog/du-nouveau-chez-les-hygrophorus/

Fungal Systematics and Evolution: FUSE 8, Sydowia 2921, 74: 193–249.

Par Lebeuf R., Alexandrova A.V., Cerna-Mendoza A., Corazon-Guivin M.A., da Silva G.A., de la Sota-Ricaldi A.M., Dima B., Fryssouli V., Gkilas M., Guerrero-Abad J.C., Lamoureux Y., Landry J., Mešic´ A., Morozova O.V., Noordeloos M.E., Oehl F., Paul A., Pham T.H.G., Polemis E., Santos V.M., Svetasheva T.Yu., Tkalcˇec Z., Vallejos-Tapullima A., Vila J., Zervakis G.I., Baral H.-O., Bulyonkova T., Kalinina L., Krisai-Greilhuber I., Malysheva E., Myhrer J., Pärtel K., Pennanen M., Stallman J.K. et Haelewaters D.

Résumé : In this 8th contribution to the Fungal Systematics and Evolution series published by Sydowia, the authors formally describe 11 species: Cortinarius caryae, C. flavolilacinus, C. lilaceolamellatus, C. malodorus, C. olivaceolamellatus, C. quercophilus, C. violaceoflavescens, C. viridicarneus, Entoloma meridionale (Agaricales), Hortiboletus rupicapreus (Boletales), and Paraglomus peruvianum (Paraglomerales). The following new country records are reported: Bolbitius callistus (Agaricales) from Russia and Hymenoscyphus equiseti (Helotiales) from Sweden. Hymenoscyphus equiseti is proposed as a new combination for Lanzia equiseti, based on ITS and LSU sequence data in combination with morphological study.

Article en accès libre : DOI 10.12905/0380.sydowia74-2021-0193

Pulverulina, a New Genus of Agaricales for Clitocybe ulmicola, Southeastern Naturalist 2020, 9(3), 447-459.

Par P. Brandon Matheny, Karen W. Hughes, Jacob Kalichman, Renée Lebeuf

Résumé : A new genus, Pulverulina, is described to accommodate the monotypic lineage Clitocybe ulmicola in the Porotheleaceae. Pulverulina ulmicola is characterized by small, clitocyboid, pileate-stipitate basidiomata with a tough, pruinose stipe; distant decurrent lamellae; smooth inamyloid basidiospores; long, abundant caulocystidia; interwoven lamellar trama, and lignicolous habit on bark of living trees. A taxonomic description and illustrations are provided together with molecular phylogenetic analysis of 14 genera of Porotheleaceae. One new taxon and 3 new combinations are proposed: Pulverulina gen. nov. and Pulverulina ulmicola comb. nov., Hydropus rugosodiscus comb. nov., and Leucoinocybe auricoma comb. nov.

Article en accès propriétaire : https://doi.org/10.1656/058.019.0301

New species in the Gymnopilus junonius group (Basidiomycota: Agaricales), Botany 2020, 98, 293–315.

Par R. Greg Thorn, David W. Malloch, Irja Saar, Yves Lamoureux, Eiji Nagasawa, Scott A. Redhead, Simona Margaritescu, Jean-Marc Moncalvo

Résumé : Les champignons identifiés Gymnopilus spectabilis et G. junonius ont été largement rapportés en Amérique du Nord, tant sur des bois durs morts que sur des conifères morts ou vivants. À partir des séquences d’ADN de la région de l’espaceur interne transcrit (ITS) et de la grande sous-unité ribosomale (LSU), les auteurs ont découvert que, bien que Gymnopilus junonius (= G. spectabilis s. auct.) soit répandu en Europe, en Amérique du Sud et en Australie, aucune des quelques séquences disponibles en Amérique du Nord ne représente cette espèce. Ils rapportent cinq espèces appartenant à ce groupe en Amérique du Nord, dont trois espèces décrites précédemment, G. luteus, G. subspectabilis et G. ventricosus ainsi que deux nouvelles espèces, Gymnopilus voitkii et Gymnopilus speciosissimus. Ils reconnaissent une espèce soeur de G. luteus à partir de séquences précédemment rapportées pour correspondre à G. spectabilis de Chine, du Japon et de l’Extrême-Orient russe, mais faute de matériel pour la décrire comme nouvelle espèce, ils lui donnent un nom de clade informel, /sororiluteus. Une autre nouvelle espèce membre de ce complexe est décrite au Japon comme Gymnopilus orientispectabilis. Les espèces membres de ce groupe peuvent se distinguer par les séquences de leur ITS ainsi que par leur macro- et micromorphologie, leur substrat et leur géographie. [Traduit par la Rédaction de la revue]

Article en accès propriétaire : https://doi.org/10.1139/cjb-2020-0006

A novel approach for tracing mycophagous small mammals and documenting their fungal diets, Botany 2019, 97(9).

Par Véronique B. Cloutier, Yves Piché, J. André Fortin, Jean A. Bérubé, Hélène Glémet et André Desrochers

Résumé : Afin d’étudier les champignons présents dans l’alimentation des micromammifères, les auteurs ont développé une méthode combinant l’échantillonnage passif (méthode sans capture) et le metabarcoding de l’ADN présent dans les fèces récoltées. Les espèces de micromammifères et de champignons ont été identifiées en analysant l’ADN génomique provenant de 596 échantillons fécaux échantillonnés dans cinq secteurs de la forêt boréale de l’Est du Canada. L’identification des espèces de micromammifères a été effectuée grâce à la région du cytochrome b de l’ADN animal. Un total de huit espèces de micromammifères avait consommé des champignons hypogés lors de l’étude. Les principaux consommateurs étant le grand polatouche (Glaucomys sabrinus) et le campagnol à dos roux de Gapper (Myodes gapperi). La région de l’espaceur transcrit interne (ITS) a été utilisée pour identifier les champignons présents dans leur alimentation. Les auteurs ont confirmé la présence de 722 ascomycètes, 429 basidiomycètes, 81 zygomycètes, 4 chytridiomycètes, 1 gloméromycète et 44 taxons fongiques non identifiés. Parmi ceux-ci, 28 étaient des champignons hypogés (fructification souterraine) considérés comme ayant été déterrés par les micromammifères pour leur consommation. Sinon, quant aux autres champignons tels que les espèces épigées (fructification au-dessus du sol) ou les espèces microscopiques, il n’apparaît pas clairement lesquels sont choisis par l’animal comme source alimentaire ou résultent d’une contamination fortuite. Cet article présente une approche prometteuse de dépistage de la mycophagie chez les micromammifères. De plus, les données des auteurs suggèrent que la diversité fongique est importante dans l’alimentation de certains micromammifères. [Traduit par la Rédaction]

Artice en accès propriétaire :  https://doi.org/10.1139/cjb-2018-0222

Validation of two Amanita species from eastern North America: A. rhacopus sp. nov. and A. variicolor sp. nov., Mycokeys 2018, 38, 37-47.

Par Herman Lambert, Guy Fortin, Roland Labbé, Jacqueline Labrecque, Jean A. Bérubé, Jacques Landry, Evgeny Ilyukhin, Simona Margaritescu, Jean-Marc Moncalvo, Yves Lamoureux

Résumé : Members of the mushroom genus Amanita usually can easily be identified to the genus in the field, however, species circumscription and identification are often problematic. Several names have been misapplied and cryptic species exist. Here, we formally describe and validate two new species of Amanita sect. Vaginatae from eastern North America that were recognised under the umbrella European names A. ceciliae by past authors: Amanita rhacopus sp. nov. and Amanita variicolor sp. nov.

Article en accès libre :  https://mycokeys.pensoft.net/article/27041/ 

Hidden diversity uncovered in Hygrophorus sect. Aurei (Hygrophoraceae), including the Mediterranean H. meridionalis and the North American H. boyeri, spp. nov., Fungal Biology 2018, 122, 817-836.

Par Pierre-Arthur Moreau, Jean-Michel Bellanger, Renée Lebeuf, Zacharias Athanassiou, Antonis Athanasiades, Herman Lambert, Christian Schwarz, Ellen Larsson, Michael Loizides

Résumé : For many years, the binomial Hygrophorus hypothejus was widely applied to collections from various geographical regions in different continents, assuming a circum-boreal and circum-mediterranean distribution for this species. This hypothesis, however, had never been put to the test. To assess the diversity and species-limits within this complex of yellow-coloured waxcaps, a phylogenetic, morphological and taxonomical investigation into Hygrophorus sect. Aurei and similar species in sect. Olivaceoumbrini was carried out, including material of pan-European origin, as well as the east and west coasts of North America. Following sequencing of the ITS rDNA locus, nine lineages are confirmed in sect. Aurei, most of them  highly continentalised. Of these, two are new to science, introduced here as Hygrophorus boyeri sp. nov., from Pinus banksiana and P. rigida forests in eastern North America and from P. muricata and P. contorta forests in western North America, and Hygrophorus meridionalis sp. nov., from Pinus brutia and Pinus halepensis forests in the island of Cyprus and mainland Greece. H. hypothejus is lectotypified and epitypified, and here resolved as a strictly European species, with the old forgotten taxon Hygrophorus siccipes revived as its North American vicariant. The placement of Hygrophorus fuligineus in sect. Aurei is phylogenetically confirmed and detailed comparisons between morphologically similar and phylogenetically affiliated taxa in sect. Aurei and sect. Olivaceoumbrini are provided. The chronic confusion associated with Hygrophorus fuscoalbus, a highly controversial taxon described from Germany nearly two centuries ago and variously interpreted since, is discussed, concluding that this name is too ambiguous to be applied to any currently recognized species.

Article disponible sur Research Gate :  https://www.researchgate.net/search

The golden chanterelles of Newfoundland and Labrador: a new species, a new record for North America, and a lost species rediscovered, Botany 2017, 95, 547–560.

Par R. Greg Thorn, Jee In Kim, Renée Lebeuf, and Andrus Voitk

Résumé : Trois espèces de chanterelles dorées ont été trouvées à Terre-Neuve et Labrador et comparées à d’autres espèces de Cantharellus par des études en macromorphologie, en microscopie et en phylogénie multi-locus. L’espèce la plus commune est un membre du groupe C. cibarius, habituellement trouvé avec Picea, et qui se différencie de C. cibarius européen par son hyménium rose-orangé plutôt que jaune, et de C. cibarius et C. roseocanus du Pacific Northwest par les séquences de son ITS et de TEF1. Les auteurs la décrivent comme une nouvelle espèce, Cantharellus enelensis; les séquences publiées étendent sa distribution au Michigan et en Illinois. Une espèce peu commune comportant un hyménophore mérulioïde réduit, qui croit seulement avec Betula, possède des séquences d’ADNr et de TEF1 quasi identiques à celles de C. amethysteus mais ne présente qu’occasionnellement seulement, des écailles améthystes sur son chapeau, caractéristiques de cette espèce en Europe. Il s’agit du premier signalement de cette espèce en Amérique du Nord. Une troisième espèce a été reconnue par sa séquence comme étant C. camphoratus, mais les collections des auteurs, trouvées avec Abies balsamea, sont dépourvues de l’odeur camphrée d’après laquelle cette espèce a été nommée et possèdent des spores plus longues et plus minces que celles décrites à l’origine. Cette espèce n’a pas été rapportée depuis sa description à partir d’une seule collection en Nouvelle-Écosse. Les trois espèces sont comestibles. [Traduit par la Rédaction de la revue] 

Article disponible à l'adresse suivante : http://www.nlmushrooms.ca/publications/2017-1%20chanterelles.pdf

Hygrocybe jackmanii Lebeuf, Thorn, Boertm. & Voitk, sp. nov., Persoonia, 2015, 35.

Fungal Planet Description Sheet 389 

Hygrocybe jackmanii Lebeuf, Thorn, Boertm. & Voitk, sp. nov. 

Etymology. Name is a tribute to Captain William Jackman, who swam back and forth from shore 27 times to save 27 persons from a storm-grounded ship. Hygrocybe jackmanii fruits during the same stormy early October on the same Labrador shores where Jackman’s heroic feat took place.

Colour illustrations. Hygrocybe jackmanii in situ in Labrador sand dune. Upper insert shows characteristic growth in sand, on the border of heath, but not in the heath. Close to moss, dune grass, alder and crowberry; the last (Empetrum nigrum) is the most consistent close potential partner. Lower insert shows elongated spores, 11.8–15.1 μm in length. Among red species of Hygrocybe with a dark disc, only H. andersonii as longer spores. Scale bar = 10 μm.

Article en accès libre : 

https://www.fungalplanet.org/content/pdf-files/FungalPlanet389.pdf

DNA barcoding of Boletales collections hosted in the Biodiversity Centre Fungarium

Par Stefani F.O.P.1, Megarbané L., Lebeuf R., Lamoureux Y., Archambault R. 

Studies of fungal communities usually use only one method of identification: either morphological or molecular. For macrofungi, there are potential problems with both methods — use of morphology requires presence of fruit-bodies and considerable experience and molecular identification relies on existence of a comprehensive barcode database. Fungarium collections allow testing of morphological species as used in field surveys against molecular species as distinguished by use of the ITS region, which has recently been confirmed as the barcode region for fungi.

Article en accès propriétaire . DNA Barcoding of Boletales

Multi-gene phylogenetic analyses reveal species limits, phylogeographic patterns, and evolutionary histories of key morphological traits in Entoloma (Agaricales, Basidiomycota), Persoonia 2013, 31, 159-178.

Par L.N. Morgado, M.E. Noordeloos, Y. Lamoureux, J. Geml

Résumé : Species from Entoloma subg. Entoloma are commonly recorded from both the Northern and Southern Hemispheres and, according to literature, most of them have at least Nearctic-Palearctic distributions. However, these records are based on morphological analysis, and studies relating morphology, molecular data and geographical distribution have not been reported. In this study, we used phylogenetic species recognition criteria through gene genealogical concordance (based on nuclear ITS, LSU, rpb2 and mitochondrial SSU) to answer specific questions considering species limits in Entoloma subg. Entoloma and their geographic distribution in Europe, North America and Australasia. The studied morphotaxa belong to sect. Entoloma, namely species like the notorious poisonous E. sinuatum (E. lividum auct.), E. prunuloides (type-species of sect. Entoloma), E. nitidum and the red-listed E. bloxamii. With a few exceptions, our results reveal strong phylogeographical partitions that were previously not known. For example, no collection from Australasia proved to be conspecific with the Northern Hemisphere specimens. Almost all North American collections represent distinct and sister taxa to the European ones. And even within Europe, new lineages were uncovered for the red-listed E. bloxamii, which were previously unknown due to a broad morphological species concept. Our results clearly demonstrate the power of the phylogenetic species concept to reveal evolutionary units, to redefine the morphological limits of the species addressed and to provide insights into the evolutionary history of key morphological characters for Entoloma systematics. New taxa are described, and new combinations are made, including E. fumosobrunneum, E. pseudoprunuloides, E. ochreoprunuloides and E. caesiolamellatum. Epitypes are selected for E. prunuloides and E. bloxamii. In addition, complete descriptions are given of some other taxa used in this study for which modern descriptions are lacking, viz. E. subsinuatum, E. whiteae, E. flavifolium, E. luridum, E. bloxamii, E. madidum, E. corneri, E. callidermum and E. coeruleoviride.

Article en accès libre : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3904048/

Essai de découpage systématique du genre Scutiger (Basidiomycota): Albatrellopsis, Albatrellus, Polyporoletus, Scutiger et description de six nouveaux genres, Mycotaxon 2010, 111, 431–464.

Par Serge Audet

Résumé – Le genre Scutiger au sens traditionnel renferme au moins dix genres distincts : Albatrellopsis, Albatrellus, Polyporoletus et Scutiger, ici amendés, et six introduits comme nouveaux: Laeticutis, Neoalbatrellus, Polyporopsis, Polypus, Xanthoporus, Xeroceps. Une clé des genres issus du démantèlement du genre Scutiger s. lat. est proposée, ainsi qu’une clé des espèces signalées en Amérique du Nord et en Europe. La position systématique de ces genres est discutée d’après les résultats d’analyses moléculaires, ainsi que les caractéristiques trophiques des espèces étudiées. Divers points de taxinomie sont étudiés; en particulier la synonymie entre Polyporopsis (Albatrellus) mexicanus et Polyporoletus sublividus est rejetée. Une nouvelle espèce, Polyporoletus bulbosus, et onze combinaisons nouvelles sont proposées.

Article disponible sur le site de l'auteur : https://sergeaudetmyco.com/articles-deja-publies-dans-des-revues/

Une récolte du champignon Cotylidia carpatica au Québec, Le Naturaliste Canadien, 2008, 132(1).

Par Pierre-Arthur Moreau et Serge Audet
 

Le genre Cotylidia regroupe une douzaine d’espèces de champignons (Basidiomycètes, Polyporales, Podoscyphaceae) ressemblant à des Polypores, mais à surface fertile lisse, chair mince, et forme typique en pétale ou en cornet. Fréquents sous les tropiques, les Cotylidia sont rares en zone tempérée. Quatre espèces de très petite taille, terrestres ou associées aux mousses, ont été décrites pour l’Europe : Cotylidia undulata, C. carpatica, C. guttulata et C. muscigena. Les mentions de ces espèces sont rares dans la littérature ; la forme des carpophores (en entonnoir chez C. undulata, spatulée ou en pétale chez les autres) et la taille des spores (produites à la face inférieure des carpophores) sont les principaux caractères considérés comme significatifs.

La découverte de Cotylidia carpatica (Pilát) Huijsman, la plus petite espèce de ce genre (à peine 1 cm de hauteur) sur un talus moussu aux environs de Québec, pour la première fois sur le continent américain, nous a incités à présenter une description complète de ce champignon très peu connu, proche de Cotylidia undulata mais en différant par un pied latéral (non central) et un chapeau zoné en forme de spatule.

Article disponible à l'adresse suivante :

https://www.researchgate.net/publication/342658432_Tire_a_part_Une_recolte_du_champignon_Cotylidia_carpatica_au_Quebec